RSUD Kepulauan Seribu memiliki poli-poli spesialis, diantaranya adalah poli penyakit dalam. Klinik penyakit dalam ini memberikan pelayanan penanganan masalah kesehatan organ dalam tanpa bedah, seperti diabetes melitus, sakit ginjal, sakit lambung, lever, dll. Ditangani oleh dokter ahli penyakit dalam yang profesional dan berpengalaman dibidangnya serta ditunjang dengan fasilitas yang memadai sesuai dengan kebutuhan pasien. Sehingga keluhan pasien mengenai penyakit dalam dapat ditangani dengan baik.

Poli Penyakit Dalam RSUD Kepulauan Seribu berada di lantai 2.